1. กำหนดนโยบายและกำกับดูแลการดำเนินงานของโรงพยาบาล รวมทั้งติดตามและประเมินผลการดำเนินงานของส่วนงานให้เป็นไปตามวัตถุประสงค์ และสอดคล้องกับนโยบายที่คณะกรรมการอำนวยการหรือมหาวิทยาลัยกำหนดไว้
2. จัดวางระบบการบริหารงานและการบริการภายในส่วนงาน เพื่อให้การดำเนินการของโรงพยาบาล เป็นไปด้วยความคล่องตัวและมีประสิทธิภาพ
3. กำหนดนโยบายการจัดหารายได้ ให้ความเห็นชอบอัตราการจัดเก็บรายได้ในการให้บริการทางการแพทย์และสาธารณสุข อัตราค่ารักษาพยาบาล การกำหนดราคายา เวชภัณฑ์ที่มิใช่ยา และเวชภัณฑ์อื่นๆที่ใช้สำหรับการให้บริการของโรงพยาบาล การให้บริการวิชาการ อัตราค่าตอบแทนจากการใช้ประโยชน์ทรัพย์สินของโรงพยาบาล
4. กำหนดกรอบอัตรากำลัง ตำแหน่งหน้าที่ คุณสมบัติของบุคลากร ตลอดจนอัตราค่าตอบแทนพิเศษอื่นใดแก่แพทย์หรือผู้เชี่ยวชาญเฉพาะด้าน ทั้งนี้โดยไม่ขัดต่อข้อบังคับและระเบียบอื่นใดว่าด้วยการบริหารงานบุคคลของมหาวิทยาลัย
5. พิจารณาให้ความเห็นชอบงบประมาณประจำปีของโรงพยาบาล ก่อนเสนอคณะกรรมการอำนวยการและมหาวิทยาลัยพิจารณาตามลำดับ
6. กำหนดคุณสมบัติ หลักเกณฑ์ วิธีการสรรหา และดำเนินการสรรหาผู้อำนวยการโรงพยาบาลเพื่อเสนอให้อธิการบดีแต่งตั้ง
7. หน้าที่อื่นใดตามที่คณะกรรมการอำนวยการมอบหมาย